Linhas de Pesquisa

Caracterização imunológica de tumores

Nesta linha de pesquisa realizamos a caracterização dos processos imunológicos em curso em diversos tumores. Estas descrições tem como objetivo identificar processos imunológicos relevantes para o surgimento e progressão dos tumores, oportunidades terapêuticas e especificidades imunológicas de reconhecimento de tumores, além do impacto de protocolos de tratamento na evolução e prognóstico de tumores. Em particular, as abordagens envolvendo estudos bioinformáticos são realizadas em colaboração com a Dra. Mariana Boroni, do INCA.

Financiamento: Ministério da Saúde - PRONON, FAPERJ, CNPq, Programa Inova FIOCRUZ

Caracterização imunológica in silico de carcinoma esofágico.

Imunohistoquímica de carcinoma esofágico.

Publicações relacionadas:

Estratégias de imunoterapia para tumores

Nesta linha de pesquisa realizamos o cultivo e modificação genética de células imunológicas com o objetivo de induzir respostas anti-tumorais.

 

Dentre as manipulações exploradas estão a transferência de receptores quiméricos de antígenos (CARs), edição genética com CRISPR e a utilização de estratégias de transferência de proteínas baseadas em trogocitose.

 

Estes objetivos incluem o desenho de sistemas moleculares que possam modular a atividade dos linfócitos e o desenho de novas moléculas de CAR com o objetivo de refinar o reconhecimento tumoral. Temos, para estes objetivos, colaborações realizadas com diversos grupos no país e no exterior.

 

Financiamento: Ministério da Saúde - PRONON, FAPERJ, CNPq, Programa de Oncobiologia - UFRJ, Programa Inova FIOCRUZ, INCT Biologia Sintética

Microscopia de fluorescência mostrando um evento trogocítico em células NK.

Carga tumoral avaliada por bioluminescência em camundongos tratados com linfócitos CAR-T.

Publicações relacionadas:

Desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas em saúde

Nosso grupo tem se dedicado a desenvolver ferramentas biotecnológicas para a modificação genética de células com aplicações em saúde. Dentre estes esforços estão o desenvolvimento de protocolos para a modificação genética de células, de ferramentas moleculares como plasmídeos para expressão de transgenes além de circuitos de optogenética e interruptores moleculares para a expressão de transgenes.

 

Esta linha em particular vem sendo desenvolvida em conjuntos com os grupos dos Drs. Elibio Rech (EMBRAPA-DF) e Cintia Coelho (UNB) com o apoio do INCT Biologia Sintética.

 

Financiamento: FAPERJ, CNPq, Programa de Oncobiologia - UFRJ, Programa Inova FIOCRUZ, INCT Biologia Sintética

Representação esquemática de promotores do tipo interruptores moleculares. 

Expressão de GFP em fibroblastos bovinos após transfecção com integrases.

Publicações relacionadas:

Gomide, M.S., Sales, T.T., Barros, L.R.C. et al. Genetic switches designed for eukaryotic cells and controlled by serine integrases. Commun Biol., 2020

 

Chicaybam L., Barcelos C., Peixoto B., et al. An Efficient Electroporation Protocol for the Genetic Modification of Mammalian Cells. Front Bioeng Biotechnol., 2017


Chicaybam L, Sodre AL, Curzio BA, et al. An Efficient Low Cost Method for Gene Transfer to T Lymphocytes. Plos One, 2013

Pedido de patente depositado:

RECH, E. ; BARROS, L. M. G. ; MURAD, A. M. ; LIMA, R. N. ; OLIVEIRA, M. A. ; ALMEIDA, M. M. S. ; MELO, E. O. ; LACORTE, C. C. ; FLORENTINO, L. H. ; COELHO, C. M. ; GOMIDE, M. S. ; SALES, T. T. ; BONAMINO, MH .
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR10201801180, Título: "MÉTODO DE REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA, MÉTODO DE PRODUZIR UMA CÉLULA TRANSGÊNICA, CASSETES DE EXPRESSÃO, VETORES DE EXPRESSÃO GÊNICA, MÓDULO DE ALTERAÇÃO DO PERFIL DA EXPRESSÃO GÊNICA E SEU USO." , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 11/06/2018

 

Plasmídios Depositados

Os plasmídios desenhados no laboratório e usados em nossas pesquisas estão depositados no repositório AddGene.

Modelagem in vitro de neoplasias mieloproliferativas

Esta linha de pesquisa é desenvolvida em conjunto com as Dras. Bárbara Reis Monte-mór e Ilana Zalcberg (CEMO-INCA) e em colaboração com os Drs. Stevens Rehen (iDOR-RJ e UFRJ) e Isabelle Plò (Gustave Roussy-Paris).

 

Avaliamos nesta linha de pesquisa o impacto biológico de diferentes mutações que ocorrem em células tronco das neoplasias mieloproliferativas. Entre as abordagens, realizamos a caracterização das mutações presentes, a reprogramação dos precursores hematopoiéticos CD34+ até células de pluripotência induzida (iPSCs) e diferenciação mielóide destas células. 

 

Financiamento: Ministério da Saúde - PRONON, FAPERJ, CNPq

Caracterização da linhagem iPS INCABRi001-A1.

Caracterização da linhagem iPS INCABRi001-A1.

Publicações relacionadas:

Secardin L., Limia CEG., di Stefano A., et al. TET2 haploinsufficiency alters reprogramming into induced pluripotent stem cells. Stem Cell Res., 2020

Ayres-Silva JP, Bonamino MH, Gouveia ME, et al. Genetic Alterations in Essential Thrombocythemia Progression to Acute Myeloid Leukemia: A Case Series and Review of the Literature. Front. Oncol., 2018 

 

Limia CEG, Devalle S, Reis M, et al. Characterization of a human induced Pluripotent Stem (iPS) cell line (INCABRi002-A) derived from a primary myelofibrosis patient harboring the 5-bp insertion in CALR and the p.W146X mutation in TP53. Stem Cell Res., 2018

Limia CEG, Devalle S, Reis M, et al. Generation and characterization of a human induced pluripotent stem (iPS) cell line derived from an acute myeloid leukemia patient evolving from primary myelofibrosis carrying the CALR 52bp deletion and the ASXL1 p.R693X mutation. Stem Cell Res., 2017

Monte-Mor BCR, Ayres-Silva JP, Correia WD, et al. Clinical features of JAK2V617F- or CALR-mutated essential thrombocythemia and primary myelofibrosis. Blood Cells Mol. Dis., 2016

Maia RC, Bonamino MH, Robaina MC, et al. An unusual long-term outcome of a child with primary myelofibrosis harboring a JAK2 mutation. Blood Cells Mol. Dis., 2015

 

Coutinho DF, Diniz C, Filgueiras RLD, et al. novel TET2 mutation in a patient with refractory cytopenia with multilineage dysplasia. Genet. Mol. Res., 2013

 

Kaeda J, Bonamino MH, Ayres-Silva JP, et al. JAK2 V617F allele burden quantified by real time quantitative polymerase chain reaction and competitive polymerase chain reaction in patients with chronic myeloproliferative neoplasia.  Leuk. Lymphoma, 2013

Zalcberg IR, Ayres-Silva JP, Azevedo AM, et al. Hydroxyurea Dose Impacts Hematologic Parameters In Polycythemia Vera And Essential Thrombocythemia But Does Not Appreciably Affect JAK2-V617F Allele Burden. Haematologica, 2011

Xavier SG, Gadelha T, Pimenta G, et al. JAK2 V617F Mutation in Patients with Splanchnic Vein Thrombosis. Dig. Dis. Sci., 2010

Demais publicações e colaborações

Bines J., Small I.A., Sarmento, R., et al. Does the Sequence of Anthracycline and Taxane Matter? The NeoSAMBA Trial. The Oncol., 2020

Olivaes J., Bonamino MH, Markoski MM. CRISPR/Cas 9 system for the treatment of dilated cardiomyopathy: A hypothesis related to function of a MAP kinase. Med Hypotheses, 2019

 

Mazzoccoli, L., Robaina, M.C., Apa, A.G. et al. MiR-29 silencing modulates the expression of target genes related to proliferation, apoptosis and methylation in Burkitt lymphoma cells. J Cancer Res Clin Oncol, 2018

Bonfim DC, Dias RB, Fortuna-Costa A, et al. PS1/γ-Secretase-Mediated Cadherin Cleavage Induces β-Catenin Nuclear Translocation and Osteogenic Differentiation of Human Bone Marrow Stromal Cells. Stem Cells Int., 2016

Sécca C, Faget DV, Hanschke SC, et al. IRF2BP2 transcriptional repressor restrains naive CD4 T cell activation and clonal expansion induced by TCR triggering. J Leukoc Biol., 2016

Vargas JE, Chicaybam L, Stein RT, et al. Retroviral vectors and transposons for stable gene therapy: advances, current challenges and perspectives. J Transl Med., 2016

Lemos AE, Ferreira LB, Batoreu NM, et al. PCA3 long noncoding RNA modulates the expression of key cancer-related genes in LNCaP prostate cancer cells. Tumour Biol. 2016

 

Menezes K, Nascimento MA, Gonçalves JP, et al. Human mesenchymal cells from adipose tissue deposit laminin and promote regeneration of injured spinal cord in rats. PLoS One. 2014

Gil Ferreira C, Aran V, Zalcberg-Renault I, et al. KRAS mutations: variable incidences in a Brazilian cohort of 8,234 metastatic colorectal cancer patients. BMC Gastroenterol. 2014

Vargas JE, Salton G, Sodré de Castro Laino A, et al. pLR: a lentiviral backbone series to stable transduction of bicistronic genes and exchange of promoters. Plasmid. 2012

Paraguassú-Braga FH, Alves AP, Santos IM, et al. An ectopic stromal implant model for hematopoietic reconstitution and in vivo evaluation of bone marrow niches. Cell Transplant. 2012

Paulsen BS, de Moraes Maciel R, Galina A, et al. Altered oxygen metabolism associated to neurogenesis of induced pluripotent stem cells derived from a schizophrenic patient. Cell Transplant. 2012

Lima LG, Oliveira AS, Campos LC, et al. Malignant transformation in melanocytes is associated with increased production of procoagulant microvesicles. Thromb Haemost. 2011

Sartore RC, Campos PB, Trujillo CA, et al. Retinoic acid-treated pluripotent stem cells undergoing neurogenesis present increased aneuploidy and micronuclei formation. PLoS One. 2011

Paulsen BS, Souza CS, Chicaybam L, et al. Agathisflavone enhances retinoic acid-induced neurogenesis and its receptors α and β in pluripotent stem cells. Stem Cells Dev. 2011

Monteiro JP, Farache J, Mercadante AC, Mignaco JA, Bonamino M, Bonomo A. Pathogenic effector T cell enrichment overcomes regulatory T cell control and generates autoimmune gastritis. J Immunol. 2008

Hassan R, Bonamino MH, Braggio E, et al. A systematic approach to molecular quantitative determination of mixed chimaerism following allogeneic bone marrow transplantation: an analysis of its applicability in a group of patients with severe aplastic anaemia. Eur J Haematol. 2004

Apoio Financeiro:

Instituto Nacional do Câncer (INCA)

Rio de Janeiro - RJ

Brasil

2020